Auch bei Charterflügen verfügt Germania über eine langjährige Erfahrung. Je nach Wunsch erhält der Kunde von der Flugplanung über die Flugvorbereitung bis zum Catering alles aus einer Hand. Namhafte große Reiseveranstalter wie Oeger Tours, TUI Deutschland und Thomas Cook gehören ebenso zu den Germania-Kunden wie kleinere Nischenanbieter. Darüber hinaus ist Germania auf die Organisation von Eventflügen und Adhoc-Charter spezialisiert.